阿衡之死令黄药师伤心欲绝，遂决定与阿衡一同离开桃花岛，周伯通见状，笑谑黄药师与阿衡一同寻死，更说出郭靖早已背熟九阴真经，黄药师闻言大怒。原来黄药师发誓，凡懂九阴真经者死，因而往杀郭靖，郭靖不知情，大感莫名其妙，后周伯通将经书撕毁，终冰释干戈，但黄药师不许黄蓉跟随郭靖等人离开桃花岛。黄蓉思念郭靖，遂毅然向黄药师辞行，却见黄药师与阿衡同在冰牢内，黄药师已一头白发，而阿衡最终也死去。于是黄蓉终于明白母亲早已死去，向黄药师纠缠母亲的死因。黄药师便将往事尽诉：王重阳死后，黄药师为了得到九阴真经先是诱骗周伯通，后让妻子阿衡默写九阴真经。但是世事难料，九阴真经被完成不久之后被梅超风和陈玄风盗取。于是黄药师再劝阿衡默写，其妻（黄蓉之母）阿衡最终积劳成疾，产下黄蓉后诀别于人世。