于成龙按照康熙皇帝“更名田”的新政，以政令的形式将田地归还给老百姓。离开罗城之后，于成龙先后升任四川合州知州、湖北黄州府同知，在黄州同知任上被朝廷第二次举为“卓异”。康熙十二年，发生“三藩之乱”，刚刚升任武昌知府的于成龙迅疾率领部属进抵武昌，受命料理军需事务。就在于成龙任职期间，三藩乱军进军湖南，攻陷岳州、长沙等地。武昌府的地理位置十分重要，巡抚张朝珍命令于成龙率领部属，征集乡民前往咸宁一带建造桥梁，以保证康亲王的大军能够顺利通过。造桥期间，于成龙得知土匪刘君孚手下有十万之众，为了不让吴三桂先一步招抚刘君孚，他派雷翠亭去招抚刘君孚。刘君孚为人豪爽，同意与于成龙见面，并表达了“我乃汉人，愿为汉鬼，但不能是汉贼”的意愿。